Bağırsaklar vücutta tek katlı epitelle korunan tek mukozadır. Vücudun dışı ile içi arasında bariyer görevi görerek, kana geçmemesi gereken molekülleri tek katlı epitelden oluşan bu mukoza hücreleri ve aralarındaki sıkı bağlar engeller, aynı zamanda yine tek katlı epitel nedeniyle kana geçmesi gereken sindirilmiş yararlı besinlerin geçişini de kolaylaştırır. Buna bağırsak kan bariyeri denir.  Yani kimin tanıdık, kimin yabancı olduğuna bağırsaklarda karar verilir. 

Ancak bir çok faktör, stres de dahil olmak üzere bu sıkı birleşme noktalarının bütünlüğünü bozarak mikrobik metabolitlerin, sitokinlerin, toksinlerin, allerjenlerin, karsinojenlerin, gıda katkı maddelerinin kan dolaşımına girmesine izin verebilirler. Uyarılan enflamasyon, beyni ve performansını doğrudan etkileyebilir. Düşüncede bulanıklık ve dikkat toplamada güçlükle ortaya çıkan “beyin sisi” beyindeki enflamasyonun bir göstergesidir