Prof. Dr. Fevzi Sefa Dereköy lise öğreniminin ardından 1987 yılında Gülhane Askeri Tıp Fakültesi'nden başarı ile mezun olarak tıp doktoru unvanını almıştır. 1999-2008 yılları arasında Afyon Kocatepe Üniversitesi'nde Kulak Burun Boğaz Anabilim Dalı kurucu öğretim üyesi olarak çalışmıştır. Bu sürede Tıp Fakültesi Dekan Yardımcılığı ve Sağlık Bilimleri Enstitü Müdürlüğü görevlerini yürütmüştür. 2008'de Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesine profesör olarak atanmış ve Tıp Fakülltesi'nde Kulak Burun Boğaz Hastalıkları Anabilim Dalı'nı kurmuştur. Aynı zamanda Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi Hastanesi'nde 2009-2010 yıllarında kurucu başhekimlik yapmıştır. 2008-2019 yılları arasında aynı Üniversitede Kulak Burun Boğaz Anabilim Dalı Kurucu Başkanlığı Uygulama Hastanesi Kurucu Başhekimliği, Yüksek Okul Müdürlüğü ve Dekanlık görevlerini yürütmüştür. Ağustos 2019 tarihinden itibaren Medipol Üniversitesi Tıp Fakültesi Çamlıca Uygulama ve Araştırma Hastanesi'nde çalışmaktadır. Öğretim Elemanları Derneği Başkanlığı Afyon TED Okul Aile Birkal Başkanlığı, Trakya Kulak Burun Boğaz Dernegi Başkanlığı gibi birçok dernek ve STK'da görev yapmıştır. Halen Türk KBB BBC Derneği Onur ve Etik Kurul üyesidir. Sosyal Bilimler Enstitüsü Tarih Anabilim Dalı'nda tezlı yüksek lisans yapmış olup Bilim Tarihi alanında basılı eserlere sahiptir. Tarihte Yüksek Lisans tezi ülkemizin ilk basılı tıp dergisi olan Vakayi Tıbbiye hakkındadır.  Prof. Dr. Fevzi Sefa Dereköy mesleki çalışmalarına Medipol Üniversitesi Çamlıca Uygulama ve Araştırma Hastanesi'nde devam etmektedir.