Ailesinde veya kendisinde hiçbir barsak problemi olmasa bile 50 yaşından sonra herkesin kolonoskopi taraması yaptırması gerekir Ailesinde kolorektal kanser veya polip olan veya genetik geçişli bir bağırsak hastalığına sahip olanlar veya iltihabı bağırsak hastalığı olanlar kolorektal kanser açısından daha erken yaşlarda kolonoskopi takibine alınmalıdır Daha önce kolorektal kanser nedeniyle tedavi gören veya polipler nedeniyle takip edilen hastalar da kolonoskopi ile takip edilmelidir Makatta kanama, bağırsak alışkanlıklarında değişiklik olanlar, sürekli şişkinlik, karın ağrısı problemi olanlar için de kolonoskopi gereklidir Karın bölgesine yapılan herhangi bir görüntüleme yönteminde kalın bağırsakta şüpheli bir şey görülürse yine kolonoskopi gereklidir Sebebi bilinmeyen anemi, gaytada gizli kan görülmesi, sebebi bilinmeyen kilo kayıpları içinde kolonoskopi yapılabilir Kolonoskopi sadece kanser için yapılmaz kolerektal kanamaların tespiti ve durdurulması, iltihabı bağırsak hastalıklarınınn tespiti, gerektiğinde tanısal biyopsi işlemleri ve polip eksizyonları gibi durumlar içinde kullanılır